加爾文堅持認爲，教會紀律彰顯的不是政治上刀劍的權力，而是屬靈的權力。它不是強制性的，而是牧養性質的。毫無疑問，當教會紀律被任意行使時，它就變成了單純的暴政。但加爾文堅持認爲，只有當這個人的行爲按著聖經是顯而易見犯了罪的、並且只有當他拒絕悔改這種行爲時，這個人才須受到懲戒。